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    Implen Journal Club:应用于微生物组学样品质控

    微生物组是指一个特定环境或生态系统中全部微生物及其遗传信息的集合, 其蕴藏着极为丰富的微生物资源。全面系统地解析微生物组的结构和功能, 将为解决人类面临的能源、生态环境、工农业生产和人体健康等重大问题带来新思路。微生物组学与传统微生物学相比较,从依赖于培养到利用高通量测序和质谱鉴定等技术作为研究手段, 在这个过程中,自然少不了利用NanoPhotometer®对样品进行质量控制,本期Implen文献俱乐部为大家带来微生物组学样品质控的专题。

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    坐标:澳大利亚莫纳什大学  杰弗里谢医学与健康科学学院

    期刊:《Antioxidants》


    肠道微生物群对我们的健康有着深远的影响——健康肠道微生物群的不平衡与肥胖和代谢综合症有关。高脂肪饮食(HFD)引起的肠道微生物群变化与体重增加、肥胖、葡萄糖不耐受、胰岛素抵抗、炎症和氧化应激密切相关。研究人员阐明了香叶苷的相关作用,香叶苷是一种多酚,与积极重塑肠道微生物组成的能力相关,具有良好的健康效果。本研究结果表明,利用香叶素和香叶素的浓缩提取物(GEE)作为营养药物和潜在的益生元来管理饮食诱导的代谢综合征的可能性,因为它被证明可以显著改善三酰甘油酯、低密度脂蛋白、糖耐量异常、脂联素和代谢性内毒素血症。这项工作为长期研究肠道微生物菌株和代谢组学的变化奠定了基础,以帮助阐明香叶苷对饮食诱导的代谢综合症的改善作用。


    NanoPhotometer®应用:对提取的基因组DNA进行浓度测量。

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    坐标:比利时鲁汶大学 药物研究所

    期刊:《Gut Microbes》


    本主题仍然围绕肠道微生物群的主题,研究人员发现菊糖作为一种益生元纤维,可用于对酒精使用障碍(AUD)患者的恢复性治疗。AUD是一种慢性复发性疾病,与营养不良、代谢紊乱和肠道微生物群失调有关,与心理症状的严重程度相关。本研究调查了通过在戒酒期间补充菊糖来调节肠道微生物群组成,是否可以改善AUD患者肠道微生物群-脑轴的改变。无论干预组如何,所有患者在戒酒期间的抑郁、焦虑和渴求分数都有所改善。有趣的是,只有经菊糖治疗的患者社交能力评分显著改善,血清脑源性神经营养因子水平升高。这项工作为进一步研究菊糖是否可以作为改善酒精使用障碍患者心理症状和生物学结果的营养方法奠定了基础。


    NanoPhotometer®应用:在Gut-Brain研究中对提取的基因组DNA进行浓度测量。

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    坐标:意大利马尔凯理工大学  生命与环境科学系

    期刊:《International Journal of Molecular Sciences》


     “骨微生物学”是一个新的跨学科研究领域,主要研究微生物群和骨骼健康的关联,一些益生菌被认为可对特定的骨健康问题的进行预防性治疗。斑马鱼幼体越来越多地被用于研究脊椎动物骨骼发育和人类疾病,如骨质疏松症、骨质疏松症和骨关节炎。研究人员发表了两个新的转基因斑马鱼系,其中包含在发育成骨细胞和骨细胞外基质中显示荧光的荧光蛋白的编码序列。这些工具被用来可视化斑马鱼骨骼的形成,以研究来自于两种益生菌:枯草芽孢杆菌和乳酸乳球菌的影响。,这项研究表明,这些益生菌环境可导致成骨细胞形成和骨基质生长和矿化的增加。这些发现证实了益生菌在促进骨骼生长和维护骨骼健康方面的相关性,为益生菌作为预防性治疗用于改善骨骼生长和健康开辟了一个新的前景,而益生菌是一个热门但尚未充分被探索的研究领域。


    NanoPhotometer®应用:测定从斑马鱼中提取的总RNA浓度

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    坐标:捷克帕拉茨基大学  医学化学与生物化学系

    期刊:《PLOS ONE》


    微生物组学现在也被看做是一个重要的代谢器官,具有影响整体人类健康的潜力,可以调节多达30多种常用药物的作用。研究人员分析了肠道微生物群通过调节药物代谢酶系统,即通过改变选定细胞色素P450(CYPs)的表达和活性,对抗菌和抗疟原虫药物甲硝唑的作用的影响,一个含血红素的酶超家族,能够代谢结构多样的外源和内源性底物。本研究发现,微生物群的缺乏显著影响甲硝唑的血浆浓度,导致血浆中母体药物的水平升高(30%)。本研究强调了肠道微生物群以及同时服用药物对CYP合成和肝脏药物代谢调节途径的影响,具有明显的临床意义。这说明了药物代谢特性的改变和肠道微生物群的复杂相互作用,并表明需要更好地了解肠道微生物群改变药物代谢的方式,提高药物治疗的疗效。


    NanoPhotometer®应用:提取的RNA的浓度定量。

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    作为核酸样本质控的理想工具,每天为数以万计的科学家使用NanoPhotometer®进行浓度测量和纯度评估。出色的性能和轻松的操作为各种“组学”研究带来便利,NanoPhotometer®已成为生命科学研究的基础工具和实验好帮手。


    本文中相关文献:

    https://doi.org/10.3390/antiox11040632

    https://doi.org/10.1080/19490976.2021.2007042

    https://doi.org/10.3390/ijms23094748

    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0259643


    转载: 江西立康 公众号 链接:https://mp.weixin.qq.com/s/pFcjLVkI-PWLl21V-fH1Yw

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